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自动转移细菌菌落

ALS CellCelector™ 自动筛选和分离细菌菌落,用于生物技术和药物研究

细菌在工业上被用来生产一些酶和其他有机分子,如酒精。此外,由于与主要使用的哺乳动物宿主系统相比,其提高了产量却降低了成本,因此开发用于生产抗体和其他药物产品的细菌宿主系统具有巨大的市场潜力。

对于后者,将所需产物的基因插入质粒中,然后用于细菌的转化。然而,并非所有转化为细菌的质粒都可能含有插入物。蓝白筛选法是一种常见的细菌鉴定方法。含有成功连接插入物的质粒的细菌呈白色,而含有不含插入物的质粒的细菌呈蓝色,这使阳性细菌的检测变得容易。

为了达到高通量和最佳产量,生产过程的自动化是非常有意义的。CellCelector 能够自动选择和分离阳性菌落,用于评估和进一步的下游处理。

细菌菌落分离工作流程

第一步,扫描和成像

Scanning of a petri dish with bacteria colonies
扫描过程
细菌菌落培养皿放置在电控载物台上(A);
扫描后的概览图像(B);
荧光照明放大区域(C)。

步骤2:检测目标菌落

定义灰度阈值的菌落检测
参考图像(C)的灰度值视图(A)。通过移动上限(蓝色条)和下限(红色条)可以定义一个灰度值范围(绿色条)并用于检测认定目标。检测到的菌落参考图像(D);在总扫描区域中检测到的菌落(概览图像B)。
Colony detection by defining grey value thresholds

步骤3:细菌菌落的自动采集

Picking of bacteria colonies with the semi-solid media picking module
半固体培养基捕获模块-用于从半液体培养基(如甲基纤维素)和固体培养基(如琼脂)中捕获细菌菌落。

机械臂自动从架子上更换安装新的挑头(左);
捕获工具在荧光照射的培养有Deinococcus 的琼脂糖培养皿中执行挑选程序(右)。

步骤4:档案记录

从琼脂糖培养皿中分离出Deinococcus的记录档案。显示了培养皿在菌落分离前(左)和后(右)的区别。
Documentation of the isolation of a Deinococcus colony

应用实例:从琼脂培养皿中准确分离出去Deinococcus

Deinococcus是一种对多种胁迫(辐射、氧化、热、旱、冷、溶剂、碱、酸、乙醇、丁醇等)具有高度抗性的细菌。此外,这种细菌的产生时间很短(大约80分钟),能够利用大量的糖、氨基酸和有机酸作为碳源进行分解代谢,这使得它在工业用途应用广泛。此外,Deinococcus细胞能够以高度稳定的方式整合来自细菌、真菌和植物的大量DNA片段,因此能够产生高度复杂的化合物,如类胡萝卜素、酶、抗生素等。
Summary of a picking experiment of Deinococcus colonies from agar plates
从琼脂培养皿上筛选Deinococcus菌落的试验总结
如图所示,包括转移前后的5个菌落(ID分别为24、119、111、57和53),转移目标孔内的菌落,菌源培养皿中的情况。
CellCelector 系统自动采集和保存整个培养皿挑选前后的图像和总览图像。
24号菌落是带荧光的。
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