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CellCelector 软件

用户友好且功能强大的软件,用于自动检测和分离单个细胞和菌落

ALS CellCelector是一个高度通用和灵活的系统,用于自动分析和挑选单个细胞和菌落。这需要一个同样灵活和强大的软件来访问CellCelector的众多功能。.

一个直观易用的图形用户界面正在引导使用者完成实验的每一步。不同的用户访问级别允许轻松访问模式,无需对新使用者进行密集培训,同时为超级用户提供高级功能、对所有参数的开放访问、校准和自定义功能。这使得简单的日常使用以及执行复杂的实验成为可能。

CellCelector 标准实验流程
CellCelector 软件的用户界面通过将实验分为5个不同的步骤,与标准实验工作流程保持一致:

  • 扫描细胞培养板和培养皿,通过需要的成像通道(亮场、相位对比度和荧光)获取和存储图像
  • 分析这些图像并检测感兴趣的细胞或菌落
  • (可选)操作员审查分析结果
  • 检测到的单个细胞和菌落的捕获
  • 实验结果的记录和输出

每个实验步骤将显示在一个专用的用户界面中,允许访问相应步骤的适当数量的功能和数据。与当前实验步骤无关的所有选项和功能都对操作员隐藏,因此降低了复杂性。

扫描

Cellcelector software: scan
装有样品的微孔板和培养皿由高分辨率相机自动扫描。从包含最常见商用微孔板规格到创建定制化规格的微孔板库中选定适用的板型。如有需要,可方便地添加其他规格微孔板、培养皿或玻片。

根据应用要求,扫描可以在亮场、相位对比度或多达6个荧光通道中进行。从相机设置(如曝光时间)到硬件设置(如滤镜设置和照明参数)的所有成像参数都存储在预定义的成像配置中。这允许通过简单的鼠标点击在不同的成像设置之间切换。对于扫描,可以选择预定义成像配置的任何组合,以通过各种扫描通道和照明方式获取多光谱图像。

软件将所有存储的扫描图像组合成扫描区域的概览图像:



分析和发现

在此步骤中,将分析所有存储的图像,并根据用户定义的参数自动检测目标细胞和菌落。

对于每个记录通道中每个发现的细胞或菌落,软件正在计算一组形态学测量值,如面积、直径、形状、球形度(圆度)等。通过对这些参数使用过滤功门,可以对分析结果进行过滤,从而只检测目标细胞和菌落。
用户友好的预览功能允许实时验证和调整分析设置。
所有参数都可以保存为预定义的分析设置,以便对标准实验进行简单的常规分析。
Analysis: morphological parameter

复审 (可选)

在分析过程中,软件生成所有检测到的对象列表,显示每个检测到的细胞或菌落的所有选定测量数据。如果需要,用户现在可通过应用其他数字过滤器或查看图像库中检测到的细胞图像来修改这些列表。通过直接在屏幕上选择感兴趣的对象,也可以将其他项添加到选择列表中。
Manual selection
Detection: object list

捕获

Picking parameter
ALS CellCelector 使用非常温和的捕获程序,捕获细胞或菌落的存活率高。因此 CellCelector 非常适合下游的细胞培养、单细胞克隆或各种分子分析方法。

CellCelector 软件支持这一点,允许用户访问广泛的挑选参数(如吸气和分配速度、体积、挑选高度等)。这些参数可以单独调整和优化,以便从单个细胞、从悬浮或半固体培养基到贴壁细胞克隆中获得理想的捕获结果。

优化这些参数不仅可以从标准细胞培养皿或培养孔板中提取物体,还可以从膜、过滤器或显微镜载玻片中提取物体。
在捕获过程中,从细胞的源板位置到它们转移后目标板和孔中位置都可以被追踪。该软件还显示了捕获过程中的实时图像,使用户对细胞挑选过程具有高度的微观可视性,便于捕获参数的优化。

为了进行质量控制,软件会在每次挑取前后自动保存图像,以便以后查看挑取结果(在白光和/或任何荧光通道中)。软件也可以验证是否成功捕获,自动记录捕获列表中每个目标细胞的状态。
Quality control of the picking process
软件可自动采集细胞捕获前后的高质量图像,并可方便地导出。
通过扫描转移目的板可以看到转移后的细胞。

存档

完整的实验数据在软件的文档页面上列出并记录了符合GLP的内容。所有数据都可以快速、方便地导出,用于建档和存档。

每一个被检测/捕获的对象都可以通过其唯一的ID进行识别,并可以在整个过程中从源板到转移目标板进行完整的跟踪。

所有捕获的细胞和克隆的图像和数字数据以及捕获前后的显微高质量数据都存储在 CellCelector软件数据库。每个细胞的源板位置和转移目标位置记录在同一列表中。这样,在下游分析后,可以很容易地重新访问成像和挑取数据(例如.PCR或培养数据)。
Documentation: result list

软件的优势和特色

  • 通过创建自己的协议和对所有参数的开放访问,完全适合研究和开发应用程序需求

  • 通过图形化的实验工作流程易于使用,并利用程序标准化进行日常工作

  • 通过大量参数实现高质量成像、复杂的图像处理和分析以及灵敏和精确的捕获,实现高度灵活性

  • 整个流程的完整性且符合GLP要求

  • 每个细胞从源板到转移目标板的数据跟踪

  • 用户自定义的实验数据导出,以便后续建档和存档

  • 通过我们自己的软件开发团队根据客户需求和建议不断改进软件


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